ジオン残党軍の指導者エギーユ・デラーズは、ガンダム２号機を背に地球連邦政府への宣戦布告を行った。一方、その２号機を追う連邦艦アルビオンのクルーたちはガンダム１号機修理のため月面都市フォン・ブラウンにいた。パイロットとしての自信を失ったコウは、そこでケリィ・レズナーという隻腕のジャンク屋と出会う。かつてジオンのパイロットだったというケリィのもとで、しばしの時を過ごすコウだったが……。