《魔法使之徒》御廚惠，一名個頭小、皮膚白皙、身材瘦弱的中學二年級學生。臉蛋像母親，五官算得上端正，不過無論是讀書或運動，都不十分在行。沒想到在他這樣平凡的人身上，也會出現不可思議的大變化──這……完全得歸功於從事鍊金術師職業的父親為他製造了一個人造妖精亞奈……除了亞奈的加入之外，他還必須與來到魔女母親身邊修行的上級魔女艾莉卡同住一個屋簷下。而這一連串不可思議的大變化，竟然是世界動搖的前兆…… 　　──1910年，哈雷彗星的『來訪』為世界揭開了魔法的序幕，在100年後的今天，世界將再度暴露在嶄新的激烈變化中……