真藤笑是個與眾不同的高中生，不但推理能力高強，還有個當警視總監的老爸。雖然本人是個厭惡麻煩的低調主義者，但不知道為什麼總是會莫名其妙跟刑案扯上關係。某次的案件中，他意外發現警方還有一個不為人知的部門〈13科〉，原來自己以往偵破的案件，最後還是得靠13科出面才能得到犯人的口供。而這個部門所使用的方法竟然是拷問…？