高中二年级学生高远伊织，在上学途中等红绿灯时，为了保护冲到货车前面的少女而被车撞上。虽然被路过的科学家草薙结女所救，但醒来后原本高中男生的身体却被改造成小学一年级的少女。到取回原本身体之前，伊织改以小学生高远伊织的身分，开始到小学上学。 俺、小学一年生、女の子！？目を覚ますと小一女子にされていた高遠伊織、高二、男。二度目の小学校生活は“初めて”だらけ！？僕らにできない秘密の女子体験がここに！！