高木藤丸（たかぎ・ふじまる）たちが、外部との連絡を絶たれ、閉じ込められている弥代学院。一夜が明け、藤丸が通信機能を回復するも、なんと英（ひで）が『BLOODY-X』を発症！　テロリストの策略により、九条大臣もが感染させられた！　目的は抗ウイルス剤と引き換えに、神島紫門（かみしま・しもん）を釈放させること！　取引期限までに弥代学院制圧ができるのか!?