母の仕事の転勤で、火山学者の父のいる宮崎へ引っ越してきた黒木綾は、低周波過敏症で、他人には聞こえない周波数の音も聞こえる体質だった。そんな綾は、最近ずっと聞こえないはずの低音がずっと鳴っていることに気づき、地震が近いことを感じる。ネズミや鳥も宮崎から逃げ始め、火山学者である綾の父親の伸夫の勤め先では、巨大地震が起こるというデータが確実になっていく。そしてついに、宮崎市沖20kmを震源とした、震度6強を観測する「宮崎沖地震」が発生し、街は壊滅的な被害を受けるのであった。