1869年，开罗。一枚炸弹在正庆祝新苏伊士运河开通的总督歌剧院内爆炸，来访的刺客Pierrette Arnaud在调查的途中却意外发现了一个威胁兄弟会的阴谋……出人意料的是，她的老友兼老师Simeon Price同样的方式抵达埃及，七年前他们在曾携手在伦敦粉碎了神殿骑士的阴谋。但此刻已没有空闲去回忆往昔了，欧洲与非洲如棋盘上的棋子一般被圣殿骑士所操控，浩劫四起。 当Simeon与Pierrette奋力阻止进一步的袭击时，他们发现了一张图，暗指某座神秘的塔楼是控制圣殿骑士的关键所在……他们掌握着迷雾重重的历史引擎，也许终将会扼住刺客的咽喉。