我々[区役所]が、人類の脅威[有害超獣]を鎮圧するまでの極秘記録―― 2017年11月。深い霧と共に超自然的脅威「有害超獣」が出現。あれから3年以上の戦いを経て、ついに我々が反旗を翻す刻が訪れる。新たな職員や重機、激動する超獣、そして事案の顛末をここに記す。