喜欢魔术的高中生黑羽快斗，偶然发现了藏在自己房间里的密室。这个密室是他的父亲──世界知名的魔术家黑羽盗一，在8年前一次事故中神秘死去前所使用的。密室中存放著8年前消失的神秘大盗怪盗奇度的装备和服装。黑羽快斗穿上怪盗奇度的服装，并与父亲多年前的助手，如今正在假扮怪盗奇度的寺井黄之助相遇，才知晓自己的父亲当年是死于谋杀。为了揭开父亲的死因，黑羽快斗决定继承父亲怪盗奇度的身份，并且调查父亲的死因。 　　在调查的时候，黑羽快斗偶然和一支称他为“黑羽盗一”的神秘组织相遇。原来这个组织，为了寻找一种可以带来长生不老的神秘宝石命运之石“潘朵拉”，而将妨碍到他们的黑羽盗一杀死。快斗因此开始了与神秘组织的交锋，试图阻止他们的野心。