擁有著妖精般天真無邪個性的混血雙胞胎小杏與小堇，最喜歡黏著知名模型師哥哥的富士夫。升上國中後，從小黏在一起的兩人，也有了許多全新的體驗。因為小杏的課外活動，讓小堇第一次體會到落單的感覺。跟小學好友的有美、阿博與小堇之間的微妙三角關係，小杏該如何看待呢？『少女質數』將帶領大家進入這對無敵可愛雙胞胎姊妹的夢幻世界。