宿敵ラオモト・カンとの最終決戦!! 満身創痍ながらも、ついにラオモト・カンの待ち受けるトコロザワ・ピラーへと辿り着いたニンジャスレイヤー。そこには宿敵・ダークニンジャと、精鋭ニンジャ集団ソウカイ・シックスゲイツが待ち受けていた!