ウェストゼネティックス。 そこは人間に脅威をもたらすノヴァに 対抗できる力を持つパンドラと呼ばれる 少女たちを養成する軍事教育機関の一つ。 新入生のティシーは春に行われたカーニバルで ０点を取ってしまい、いじめられていた。 そんなある日、遅れてやってきた新入生 シフォン＝フェアチャイルドが現れたことで、 彼女のそれまでの日々が変わっていく。