14年前、彗星が月に衝突し、月の欠片が6つの隕石となって地球に落下した。 　　隕石が落下した街は瓦礫の山と化した。その街の一つ、月之宮市では特殊な能力を持つ子供たちが生まれた。 　　その能力を使った犯罪に対処するため、公安特課は未成年のムーンチャイルドに協力を仰ぐ。 　　その特課に所属する真田宗太は、不思議な少女・立花ひなたと出会い、共同生活をすることになる。