小宮市在住のトールとエールは、某日の理科の授業で見た映画にデジャビュを覚え、これが原因でタイムネットの世界の異変になることが、時の老人から告げられた。そして、トールは過去世界へ、エールは未来世界でモンスターを捕まえて時の柱を復元を目指して冒険がスタートする。