故事舞台的“要塞学园”原名“旭日学园”，由担心教育荒废的日本政府设置的“教育管理省”直接管辖，是全国学校臭名昭著的不良学生的最后去向。学园被密林包围，那里放养着各种猛兽。职员们带着来福、机关枪，被允许射杀反抗的学生。这是一旦进入就再也出不来的“要塞”。故事围绕着被新送入这座要塞学园的多岐澤樹、升田弦太郎、真藤明三人而展开……